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近岸类器官课堂-结直肠癌

作者:苏州近岸蛋白质科技股份有限公司 2022-07-05T15:07 (访问量:3649)

结直肠癌(Colorectal Cancer, CRC)是全世界最常见的癌症之一。在过去的十年中,预防性筛查项目的推广使死亡率大幅下降,然而在许多国家范围内,结直肠癌仍然是癌症相关死亡的第二大原因【1】

 

 

几十年来,癌细胞系和基因编辑小鼠【2】一直是CRC研究的主要模型,人类肿瘤患者衍生异种移植(PDX)也已成为了CRC研究的工具【3】。与此同时,能够在体外进行长期培养的原发性/转移性CRC类器官模型进一步扩大了研究人员的选择范围。类器官既可以像PDX一样代表了个体患者的真实肿瘤情况,又兼具了细胞系的可传代、易于高通量筛选等特性。因此,CRC类器官模型正在广泛应用于药物研究、个性化医疗等领域。

 

 

本篇文章基于Nature Chemical Biology【4】STAR protocols【5】Nature protocols【6】Cell【7】发表的四篇文章,整理了人类结直肠癌组织来源的类器官培养方案。

 

 

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图1. 病人组织来源的CRC类器官研究方案【8】

 

 

细胞来源

 

活检样本或手术样本

 

 

培养基配方

 

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组织处理

 

 

1. 将新鲜CRC组织样本放入预冷的PBS中,剔除脂肪组织和坏死的肿瘤组织(通常为黄色或白色),只选取活的肿瘤组织(通常为粉红色)。

 

 

2. 将CRC组织转移到含有5 mL预冷的PBS溶液中清洗,去除血液和碎片。为防止污染,需要多次重复此步骤至液体变澄清。

 

 

3. 吸出PBS,将组织切割为1-2 mm3的小块,此步骤可以留存适量组织用于测序、免疫组化分析等。

 

 

4. 将剩余组织块切碎,并加入1 ml预冷的类器官培养基,用p1000吸头将肿瘤碎片悬浮液转移到含有5 ml解离培养基的离心管中,轻轻震荡混匀后,放置于37℃培养箱中解离1 h。每隔15min轻轻震荡或吹打混匀一次。

 

 

5. 加入8ml 预冷的DMEM/F12(含10%FBS)终止消化。

 

 

6. 将悬浮液经过70μm细胞筛网过滤,收集解离的细胞。

 

 

7. 将过滤的细胞悬液在4℃条件下450g离心5min。

 

 

8. 若细胞沉淀有明显的红色,则将细胞重悬于5ml的红细胞裂解液中,冰上孵育10min使红细胞裂解。

 

 

9. 向细胞悬液中加入5ml DMEM/F12冲洗细胞一次,离心收集细胞沉淀后,加入1-2ml DMEM/F12重悬细胞,并进行台盼蓝染色和细胞计数。

 

类器官培养

 

 

10. 将冻存的Matrigel在4℃下过夜解冻,在冰上以3:1的体积比将Matrigel与细胞悬液混合,轻轻吹打混匀避免产生气泡。

 

 

11. 从37℃培养箱中取出预热的24孔板,将80μl混合液接种在各孔中,注意需接种在孔的中心,避免接触侧壁。

 

 

12. 将24孔板室温放置5min后,转移至37℃,5%CO2的培养箱中孵育10min,使Matrigel固化。

 

 

13. 向每个孔中缓慢滴加650μl 预热的类器官培养基,确保基质胶被完全覆盖。放于37℃,5%CO2的培养箱中培养,每2-3天更换培养基(用于换液的类器官培养基内不含Y27632)。

 

类器官传代

 

 

14. 吸出类器官培养液,机械分离Matrigel,然后加入500μl胰蛋白酶,放置于37℃培养箱中孵育1-2min后,用移液器多次吹打,从基质胶中释放类器官。

 

 

15. 用含有10%FBS的DMEM/F12培养基终止消化,在4℃条件下300g离心5min。

 

 

16. 用冷PBS清洗后,再次4℃条件下300g离心5min。

 

 

17. 将所得沉淀按照1:3-1:5的比例重复10-13步骤(具体比例通过类器官的汇合度确定),完成传代。

 

类器官冻存

 

 

18. 取1-2个孔的类器官,消化离心后取细胞沉淀,加入1ml细胞冻存液。

 

 

19. 将细胞重悬后转移至冻存管中,利用程序降温盒缓慢降温至-80℃。

 

 

20. 第二天,将样品转移到液氮中长期储存。

 

类器官复苏

 

 

21. 将液氮冻存的CRC类器官放置在37℃水浴锅中进行解冻,水浴时间不宜超过2min。

 

 

22. 将细胞悬液转移至15ml离心管中,加入10ml预冷的DMEM/F12培养基(含10% FBS)。4℃条件下300g离心5min,取细胞沉淀。

 

 

23. 将所得沉淀重复10-13步骤,完成CRC类器官复苏。

 

 

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图2. 显微镜下CRC类器官的形态,以及Ki-67、E-Cadherin标记物的表达【5】

 

 

利用类器官技术,能够将CRC和正常结直肠组织在体外进行长期扩增,并且在微卫星稳定(MSS)来源的CRC类器官中发现,类器官模型能够保留样本的遗传多样性和形态稳定性【9】。结直肠(癌)类器官的进一步优势包括可以进行建库、细胞异质性研究、实验动物移植、个体患者分析和基因编辑,目前已经成为了疾病建模的优秀工具,未来可能在再生医学领域大放异彩【10】

 

 

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图3. 结直肠(癌)类器官在基础和临床研究中的应用【10】

 

 

 

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参考文献

 

【1】TORRE, Lindsey A., et al. Global cancer statistics, 2012. CA: a cancer journal for clinicians, 2015, 65.2: 87-108.

 

 

【2】EVANS, Jonathan P., et al. From mice to men: Murine models of colorectal cancer for use in translational research. Critical reviews in oncology/hematology, 2016, 98: 94-105.

 

 

【3】BROWN, Kai M., et al. Patient-derived xenograft models of colorectal cancer in pre-clinical research: a systematic review. Oncotarget, 2016, 7.40: 66212.

 

 

【4】TOSHIMITSU, Kohta, et al. Organoid screening reveals epigenetic vulnerabilities in human colorectal cancer. Nature Chemical Biology, 2022, 18.6: 605-614.

 

 

【5】BERGIN, Christopher J., et al. Protocol for serial organoid formation assay using primary colorectal cancer tissues to evaluate cancer stem cell activity. STAR protocols, 2022, 3.1: 101218.

 

 

【6】FUMAGALLI, Arianna, et al. A surgical orthotopic organoid transplantation approach in mice to visualize and study colorectal cancer progression. Nature protocols, 2018, 13.2: 235-247.

 

 

【7】VAN DE WETERING, Marc, et al. Prospective derivation of a living organoid biobank of colorectal cancer patients. Cell, 2015, 161.4: 933-945.

 

 

【8】SASAKI, Nobuo, et al. Studying cellular heterogeneity and drug sensitivity in colorectal cancer using organoid technology. Current Opinion in Genetics & Development, 2018, 52: 117-122.

 

 

【9】BEHJATI, Sam, et al. Genome sequencing of normal cells reveals developmental lineages and mutational processes. Nature, 2014, 513.7518: 422-425.

 

 

【10】BARBÁCHANO, Antonio, et al. Organoids and colorectal cancer. Cancers, 2021, 13.11: 2657.

 

 





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