Shotgun LC-MS/MS（鸟枪法液相色谱-串联质谱）是蛋白质组学研究中的一种关键技术，其名字来源于“鸟枪”这一形象的比喻，意指对复杂生物样品中的蛋白质进行全方位、无偏见的分析。Shotgun LC-MS/MS在蛋白质组学研究中具有应用价值。它能够帮助研究人员全面了解生物样本中的蛋白质组成及其变化，揭示蛋白质在生物过程中的功能和机制。Shotgun LC-MS/MS（鸟枪法液相色谱-串联质谱）还广泛应用于疾病研究中，通过比较健康与病变组织中的蛋白质表达差异，寻找疾病相关的生物标志物。在药物研发中，该技术也被用于监测药物对蛋白质组的影响，为新药的开发和优化提供支持。Shotgun LC-MS/MS（鸟枪法液相色谱-串联质谱）的应用还扩展到环境监测、食品安全、农业科学等多个领域。在环境监测中，该技术用于分析环境样本中的蛋白质，评估环境污染对生物体的影响。在食品安全领域，Shotgun LC-MS/MS（鸟枪法液相色谱-串联质谱）用于鉴定食物中的过敏原和病原体蛋白质，提高食品安全检测的准确性。在农业科学中，该技术帮助研究作物的蛋白质组，为提高作物产量和抗性提供科学依据。

一、Shotgun LC-MS/MS的技术流程

1、样本制备

（1）蛋白质提取：从生物样本中提取蛋白质是进行Shotgun LC-MS/MS（鸟枪法液相色谱-串联质谱）分析的第一步。蛋白质提取方法需根据样本类型进行优化，以保证提取蛋白质的完整性和纯度。

（2）酶解：提取的蛋白质通常通过胰蛋白酶等酶进行酶解，生成多肽混合物。酶解步骤需严格控制条件，以确保多肽的均一性和代表性。

2、液相色谱分离

（1）样品加载：酶解后的多肽混合物通过进样系统加载到液相色谱柱中。样品加载需保证定量准确，以避免对后续分析的影响。

（2）分离：利用液相色谱系统对多肽混合物进行分离。通过调节流动相的梯度，能够实现对不同极性和大小多肽的分离，为质谱分析提供高分辨的样品。

3、质谱分析

（1）质谱仪设置：质谱仪的设置需要根据样品特性和研究目标进行优化，包括离子源参数、碰撞能量等，以提高检测灵敏度和数据质量。

（2）数据采集：通过质谱仪对分离得到的多肽进行检测，获取其质荷比信息。通过串联质谱技术，能够进一步获得多肽的序列信息，进行蛋白质鉴定。

二、Shotgun LC-MS/MS的优势与挑战

1、优势

（1）高通量：Shotgun LC-MS/MS（鸟枪法液相色谱-串联质谱）能够在一次实验中分析数千种蛋白质，极大提高了蛋白质组学研究的效率。

（2）高灵敏度：该技术能够检测低丰度蛋白质，帮助研究人员发现传统方法难以检测的生物分子。

2、挑战

（1）数据复杂性：Shotgun LC-MS/MS的数据分析需要处理大量的质谱数据，涉及复杂的算法和计算资源。

（2）样品复杂性：生物样本中的蛋白质种类和浓度差异较大，可能影响分析的准确性和可重复性。

百泰派克生物科技提供专业的Shotgun鸟枪法蛋白质鉴定服务，我们的团队拥有丰富的经验和专业知识，能够为您的研究提供高质量的数据和深入的分析。我们的服务涵盖从样本制备到数据处理的全流程，确保您获得可靠的研究结果。欢迎与我们合作，共同探索蛋白质组的奥秘。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

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