靶向代谢组学作为代谢组研究中的核心策略之一，凭借其高灵敏度、高特异性和高重复性，已广泛应用于生命科学、医学研究和临床转化等多个领域。然而，任何技术都有其两面性，靶向代谢组学也存在一定的局限性。

一、靶向代谢组学的主要优势

1、高灵敏度与高特异性检测

靶向代谢组学基于多反应监测（MRM）或选择性反应监测（SRM）模式，对已知代谢物的特定离子对进行追踪，极大提升了检测信噪比，适用于低丰度代谢物的精确检测。

2、绝对定量能力，结果更具生物学意义

通过添加稳定同位素内标，靶向代谢组可对代谢物进行绝对定量，为代谢通路建模、药物代谢动力学（PK）研究等提供可靠的数值基础。

3、数据高度可重复、适合大样本研究

靶向方法标准化程度高，检测参数固定，特别适用于多中心、多时间点、大队列样本的重复检测，数据稳定性远优于非靶向代谢组。

4、结果更容易解读与临床转化

由于研究对象为已知结构和功能的代谢物，科研人员可直接关联其与特定通路、疾病机制或临床表型，提高数据解释效率，便于成果转化。

5、适用于机制验证和生物标志物确认

在非靶向代谢组筛选出候选标志物后，通常需通过靶向定量方法进行进一步验证，提升研究的可信度与发表价值。

二、靶向代谢组学的局限性

1、研究范围有限，依赖已知信息

靶向代谢组只能检测预先设定的代谢物清单，对于未知代谢物或新型代谢通路的探索能力较弱，不适合发现性研究。所以在疾病机制探索早期，更适合先做非靶向代谢组，后期再用靶向方法验证。

2、方法开发成本高、周期长

每一种代谢物的MRM方法都需手动优化，包括保留时间、离子对、碰撞能量等，且不同样本基质间需反复验证，导致方法开发流程复杂。

3、标准品依赖性强，部分代谢物缺乏商用标准品

高质量定量依赖稳定同位素内标和标准品，但很多稀有代谢物、内源性代谢中间体或代谢修饰产物难以获得标准品，影响定量准确性。

4、高通量能力相对较弱

尽管现代三重四极杆支持数百个代谢物的并行检测，但相比非靶向分析（检测上千种代谢物），靶向方法的通量受限于仪器周期和MRM通道数目。

5、易忽视通路层面的“整体变化”

靶向策略更聚焦于代谢物本身，可能忽略代谢网络中其它未设定的关键节点，限制了对代谢调控的系统性理解。

三、如何优化靶向代谢组学的应用效果？

为最大程度发挥靶向代谢组学的价值，科研人员在设计实验方案时可考虑以下建议：

四、百泰派克生物科技如何助力高质量靶向代谢组研究？

百泰派克生物科技深知靶向代谢组学在科研与转化应用中的价值，致力于构建标准化、规模化、专业化的靶向代谢组服务平台：

• 自建多种核心代谢通路标准品库（糖酵解、TCA循环、氨基酸代谢等）
• 配备多台高灵敏度QqQ质谱系统，支持百级代谢物并行检测
• 搭建自动化定量流程与生信分析平台，助力科研高效输出
• 提供一对一技术咨询与数据解读服务，让实验设计更科学、结果更可靠

靶向代谢组学是代谢研究中最具定量精度和转化潜力的手段之一，尤其适合机制验证、临床检测、药物评价等目标明确的科研需求。然而，它并不适合所有场景，尤其在初期研究阶段，若目标代谢物未知，建议先采用非靶向策略。百泰派克生物科技建议您根据研究目的，合理搭配靶向与非靶向技术，制定个性化代谢组学解决方案。如您有相关实验计划，欢迎随时联系我们获取免费技术咨询与方案设计。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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