贝瑞的单细胞组学测序让科学家可以看到看似相同的群体中的差别，为科学家进一步研究解析单个细胞的行为、机制、与机体的关系提供了技术手段。

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数字基因表达谱分析（Digital Gene Expression Tag  Profiling，DGE）是直接对某一物种或特定细胞在特定功能状态下产生的mRNA进行高通量测序，研究基因的表达差异情况。通过高通量测序一次可产生1千万个以上mRNA标签，可准确检测低丰度基因转录

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转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和，包括mRNA和非编码RNA。转录组测序能够全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息。

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基因转录水平的研究是功能基因组学和医学研究的基础。数字基因表达谱利用新一代高通量测序技术和高性能计算分析技术，通过全面、经济、快速地检测某一物种特定组织在特定状态下的基因表达情况。

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使用的Illumina Genome Analyzer平台只需要极少量的样品，便可对数量有限的保存组织、拟胚体、小的模式系统和难以培养的生物进行测序。

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16S rDNA序列（在所用物种中高度保守）是最常用的细菌分类标准，通过提取环境样品的DNA，并扩增其中16S rDNA基因；通过检测16S rDNA 的序列变异和丰度，反映环境样本中细菌的分类和丰度

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